Na guia “Comercial”, clique no botão “Contratos”. Selecione o contrato e com o botão direito do mouse opção Financeiro>  “Recebimento de Parcelas”

Sobre a parcela, selecione pressionando a barra de “espaço” em seu teclado.

Ao marcar um valor inferior ao que deveria ter sido recebido, o F10 irá perguntar o motivo (estes podem ser personalizados pela escola, em “Sistema” -> “Configurações Globais”)

Ao confirmar esta operação, será exibida uma janela com as opções a serem feitas (somente usuários que possuem estes direitos conseguirão efetuar esta operação):

Veja abaixo o resultado em "Situação financeira":